Αυτό που είναι ιδιαίτερα ανησυχητικό είναι πως το 60% των μικροβίων που εντοπίστηκαν στα επαναχρησιμοποιημένα μπουκάλια είναι παθογόνα, δηλαδή ικανά να μας κάνουν να αρρωστήσουμε. Γι' αυτό τον λόγο συνίσταται όσο μπορούμε να μην τα επαναχρησιμοποιούμε και να προτιμούμε τα γυάλινα μπουκάλια ή εκείνα από ανοξείδωτο ατσάλι.
Εκτός όμως από τα μικρόβια, τα πλαστικά μπουκάλια κρύβουν και έναν άλλο κίνδυνο. Η δισφαινόλη Α (BPA) είναι μια οργανική χημική ένωση, η οποία κυρίως χρησιμοποιείται ως πρόσθετο με άλλα χημικά για την παρασκευή πολυκαρβονικών πλαστικών (PC). Πλαστικά που περιέχουν BPA παρουσιάζουν εξαιρετική ανθεκτικότητα στη θερμότητα είναι άκαμπτα, ελαφριά και διάφανα. Η ουσία χρησιμοποιείται σε διάφορες συσκευασίες τροφίμων και αναψυκτικών, σε πλαστικά μπουκάλια, ως επίστρωση σε ορισμένες μεταλλικές κονσέρβες τροφίμων και αναψυκτικών, σε οικιακά ηλεκτρικά σκεύη και σε παιδικά παιχνίδια. Η μεταφορά της ουσίας στα τρόφιμα εκτιμάται ότι μπορεί να προκαλέσει ορμονικά προβλήματα, ακόμα και καρκίνο του μαστού, ωστόσο δεν υπάρχουν αρκετές έρευνες που να το αποδεικνύουν ακόμα.