Κάπαρη Τήνου Στιφάδο (βίντεο)

250 γρ. κάπαρη Τήνου, ξαλμυρισμένη, στραγγισμένη και ξεπλυμένη
1/2 κούπα ελαιόλαδο
2 ξερά κρεμμύδια
1 κούπα μοσχάτο κρασί
1 κ.σ. μέλι
50 ml ξύδι
4 φύλλα δάφνης
1 ώριμη ντομάτα
1 κ.σ. πελτές ντομάτας
1/3 κ.γ. μπαχάρι σε κόκκους
1/4 κ.γ. μπαχάρι σκόνη
Ξύσμα από 1 λεμόνι
1/2 κούπα νερό
1/2 ματσάκι μαϊντανός
1/2 κ.γ. ανθός αλατιού
1/8 κ.γ. μαύρο πιπέρι, φρεσκοτριμμένο

Για το σερβίρισμα:

Φάβα, βρασμένη και πολτοποιημένη
Φέτες λεμονιού
Σχοινόπρασο