Το κτήριο βρίσκεται στη συμβολή των οδών Ι. Σφακιανάκη και Στρατηγού Τζανακάκη, ένα εξαιρετικό δείγμα αρχιτεκτονικής, ένα εκπληκτικό διατηρητέο κτήριο που, δυστυχώς τυλίχτηκε στις φλόγες το βράδυ της Κυριακής.
Ο δήμαρχος Χανίων, Τάσος Βάμβουκας, μιλώντας σε τοπικά μέσα, δήλωσε ότι «ο Δήμος δεν έχει καμία ευθύνη για τη φύλαξη του κτηρίου, αυτό ανήκε στη δικαιοδοσία του Υπουργείου Εθνικής Άμυνας…». Και συνέχισε, αναφέροντας: «Δεν υπήρξε δυστυχώς η ενδιάμεση φροντίδα και η επιτήρηση που χρειαζόταν και, απ’ ό,τι φαίνεται, είχαν κάποια άτομα πρόσβαση μέσα, έμεναν ίσως, και προφανώς αυτή είναι η αιτία του κακού», υπογράμμισε, μεταξύ άλλων.
Οι πυροσβέστες προσπαθούσαν να σβήσουν τη φωτιά προκειμένου αυτή να μην επεκταθεί σε διπλανούς χώρους, ωστόσο το κτήριο του Μουσείου υπέστη ολοκληρωτική καταστροφή.
Το μόνο που έχει απομείνει είναι το εξωτερικό μέρος του κτηρίου, η στατικότατα του οποίου θα εξεταστεί.
Οι αρχές διενεργούν προανάκριση για τα αίτια της πυρκαγιάς. Στο αστυνομικό μέγαρο Χανίων οδηγήθηκε αλλοδαπός ο οποίος είχε βρει κατάλυμα σε εσωτερικό χώρο του κτηρίου