Ορισμένα νησιά του συμπλέγματος είναι «πράσινα» και αυτά είναι τα εξής: Πάρος, Αντίπαρος, Αμοργός, Σέριφος, Σίφνος, Φολέγανδρος, Κίμωλος και Ίος.
Σε αυξημένο επίπεδο επιδημιολογικής επαγρύπνησης βρίσκονται τα εξής νησιά τα οποία είναι «κίτρινα»: Νάξος, Μικρές Κυκλάδες, Τήνος, Σύρος, Κέα, Κύθνος και Μήλος.
Σε «πορτοκαλί» επίπεδο βρίσκονται τα νησιά της Μυκόνου και της Σαντορίνης.